En principio, te debería de dar a elegir si quieres abrirlo con el navegador o con la app de youtube. Restaura los valores del Chrome y prueba a ver si al abrir un enlace te da la opción de elegir con que abrir.
Eso se hace en Ajustes/Aplicaciones instaladas/Chrome, y dentro veras la opción "eliminar datos". Yo lo arregle así en el MI3 que tengo. En el note 2 no he tenido que hacerlo.
Enviado desde mi Redmi Note 2 mediante Tapatalk