La última es la LMY48W. Que también ha salido hoy junto con Marshmallow. Apenas hay diferencia entre ellas. Desde que paso lo del agujero de seguridad de los MMS, Google decidió adoptar una nueva política de seguridad en la que cada 3 semanas aprox. lanza una OTA con pequeñas actualizaciones cubriendo posibles riesgos en la seguridad de Android. Normalmente estas actualizaciones viene a ocupar 12Mb aprox. asique con eso ya puedes ver que apenas hay diferencias entre las diferentes imagenes de Android 5.1.1.
Sobre la encriptación, no tengo ni idea a lo que te refieres, pero yo no tocaría nada la verdad. Android de stock en un Nexus 6 funciona estupendo.
Un saludo.