Yo tambien soy nuevo en esto de Flyme, pero mas o menos ya le agarré la mano.
Te puedo decir, que para que entre bien en deep sleep, te conviene poner todas las aplicaciones de google con permisos de inicio y de notificaciones, de ese modo vas a notar que consume menos en reposo.
Otro, que si querés tener las notificaciones en silencio, tenés que ir a la parte de sonido, y poner "sonido de notificacion" en silenciar.
Los temas que bajes para instalar desde la aplicacion de flyme, recien se instalan al otro dia de bajado (al menos asi me pasa a mi).
Para que no se te cierre una aplicacion al borrar las aplicaciones de multitarea, tenés que tener apretado el icono (en la multitarea) y se le pone un candado, y asi no se cierra.