Si ya no tienes garantía te da igual que knox esté a 0x0 o a 0x1. És una decisión personal, pero yo si no tienes garantía sí que actualizaría al bootloader nuevo.
En cuanto a las diferencias no sabría qué decirte porque yo no he llevado MGA, pero por el mero hecho de llevar el firmware actualizado yo sí que lo flashearía.
