[Aldane]

Yo tuve el mismo problema, pero aparte de hacer lo que comenta flaix.365, hay que formatear "system". He copiado y pegado las instrucciones de cómo instalarlo correctamente.
PD: no trae ningún explorador de archivos, tendrás que buscar uno en Play Store, (para tener Play Store hay que instalar las gapps, imagino que lo sabrás), y después, si quieres, insertar manualmente el explorador de archivos de Cyanogenmod11 a través de root explorer .

Al grano. ¿Como instalar AOSP?
1: Descargar ROM y Gapps
2: Copiar a la SD
3: Entrar Recovery CWM (instalar previamente si vienes de la stock JB).
4: Backup de la ROM (opcional, pero siempre es bueno tener uno).
5: Wipe data, cache and dalvik
6: Ir a Mounts and Storage y hacer format /system (NECESARIO).
7: Volver a menu, seleccionar Install zip from external storage(sd1)
8: Instala la rom
9: Instala las gapps
10: Instala zip novathor (opcional).
11: Reboot