Bueno al final no he podido averiguarlo (ver post #221) pero lo he conseguido con el programa SPB Backup versión 1.6.3:
Resumen
Spb Backup es una aplicación para crear copias de resguardo de información de su Pocket PC. Crea un archivo autoejecutable comprimido autoextraíble, y esto hace muy simple e intuitivo el proceso de resguardo y restauración de la información.
Características 
- Copia en tarjeta de almacenamiento
- Restauración de archivo personalizable
- Archivos auto-extraíbles ejecutables
- Copias de Seguridad completas o personalizables
- Compresión de la Copia de Seguridad
- Encriptación de la Copia de Seguridad
- Herramienta de PC para descomprimir
Tiene una opción que es copia personalizada y elegimos email (para el caso que sólo queramos la configuración de las cuentas y el correo). Este programa es bastante bueno ya que nos guarda las copias en un archivo.exe que se puede restaurar sin necesidad de tener instalado el programa.
Saludos