Comprueba la microSD, que ya me mató una el M2 normal.
Prueba a instalar una AOSP si quieres utilizar Fastboot, pero me parece recordar que vas a necesitar la SDK de Android instalada.
Aunque yo lo que haría sería insertar una nueva microSD con una ROM cualquiera y después si quieres lo devuelves a fábrica después de instalada.
En Fastboot le cargas CWM, entras a ella y cargas una ROM, habilitas depuración USB, etcétera después de instalada y vuelves al Flashtool para cargar la Stock. Si mal no recuerdo Flashtool no te va a permitir hacer nada sin la depuración USB habilitada (debbugging on) y pc companion me parece que poco más que inútil por software modificado.
El LED ¿No se te quedará parpadeando en rojo verdad? Si es así fuerza el apagado y en Fastboot haz lo que te digo anteriormente.
Para otra, y por si acaso te mata una microSD (mejor sacarlas antes de flashear) deja una ROM en la interna.
O bien prueba a reinstalar la ROM Z4 pero partiendo directamente desde cero y no desde la Recovery.
P.D. Para el Flashmode se conecta en este modo cuando te lo pide Flashtool no antes ya que por tiempo te va a intentar entrar (me parece que por ello te indica lo de la depuración off) y va a salir del modo en un corto periodo de tiempo.