Imagino que en notificaciones, diciéndole que no te notifique esa aplicación (Update)
Si en permisos no se activa, puede ser que solo te lo pida cuando haya alguna app que le haga falta (en V6 es así) y si no, vuelve a meterle el zip del root desde TWRP o en su defecto instalas el SuperSU desde el Play Store.