Mira a mi me paso igual, quiza suceda eso por que has cambiado de rom no lo tengo bien claro, pero con el recovery de TWRP tienes que darle wipe a todo menos al la sd luego instalas una rom al primer intento creo sale un error pero intentas de nuevo y ya tienes los 3 gb que son para apps. Yo lo solucione de esa manera quiza a ti tambien te sirva.
Otras aplicaciones pues ninguno funciona, tambien pase a la sd pero igual no aunmenta nada.