"Rootear", en principio tiene ventajas en poder trastearlo algo mas, por ejemplo poder meterle el titaniumBackup, y quitar todas las app basura de google y del fabricante, aunque con las app de asus quito pocas, por que son practicas, pesan poco y funcionan mejor que las alternativas, por ejemplo, el objetivo de la cámara no es muy bueno, pero tiene un sofware espectacular, ademas te deja instalar el xposed, que por cierto con lolipop de momento no puedo, seré solo yo?.......pero no puedo. Pero la verdadera ventaja, es el poder instalar el superuser, o similar, con el que adquieres el control total de tu teléfono y sistema operativo......
Si me equivoco que me corrijan......

PD, no hay problemas con futuras actualizaciones, sacan una herramienta para ser root en cada versión, ademas suele ser un proceso reversible
Pd2, tenéis razón, iba bien antes, pero ahora va aun mejor si cabe, después de un año con el, no siento la necesidad de cambiarlo.