Si la Desire la ha formateado y desrooteado no hay forma de saber qué ha tenido metido.
El hardware lo comprobarás al usarlo, la pantalla, sonido, vibracion...
Que yo sepa no existe ninguna aplicacion que pueda estropear la Desire, y desde luego no permanentemente.
Lo mejor es que la toquetees un rato, pruebes todo (pantalla, sonido, vibracion, cobertura, llamadas, GPS, sensor de proximidad...) y en todo caso, exige siempre la factura para confirmar que esté en garantia.