Pues mira te cuento, a mi me paso lo mismo que a ti a las horas de instalar el whatsapp siendo root, dos veces ademas, probe restableciendo todo y quitando el root y desde hace un mes o asi no me ha dado problemas, asi que, por descarte se lo achaque a la combinacion root - whatsapp, ayer me volvi a ser root y por ahora no me ha dado problemas, el tiempo dira...
En cuanto a lo del lag fix, yo tengo instalado la ROM oficial JPY que es 2.2.1 y creeme que mejora practicamente en todo, pero sobre todo mejora en velocidad, te digo que no te hace falta ningun lag fix.