Exacto. Ese mensaje ni caso.
Reinicias con el botón de power (por si las moscas) y como dice mufyto, a instalar módulos.
Por cierto yo he instalado hoy el nuevo alpha4 de esta forma :
Como había hecho un nandroid backup con el twrp antes de meter xposed lo he restaurado y así el móvil quedo limpio de restos.
Luego ya instale el arm vía recovery (con wipe cache y dalvik) y luego ya el xposed.
Todo ok. Esta es otra opción de instalación para quien tenga el nandroid de la rom previa a xposed.