Suponiendo que ya tienes el bootloader desbloqueado y un custom recovery.
La instalación por primera vez es:
Hacer un backup por cualquier cosa.
1.- Wipes (data, cache, dalvik y yo recomiendo también el system)
2.- Instalar zip de rom y gapps
3.- Reiniciar y listo
para cuando actualizas la rom solo
1.-hacer wipes a cache y dalvik
2.- instalar rom y gapps y listo no pierdes nada.
Saludos