Pues me acaba de ocurrir de nuevo. Tenía 2210 SMS, en 143 hilos y de repente desaparecieron todos menos los más antiguos y quedaron sólo 14 hilos!!
Ahora, me doy cuenta que fue cuando activé el FriendStream que desaparecieron...
Al final los pude restaurar sin problema, porque tenía el backup y lo volví a restaurar...