Eso pensaba yo! Esperaba un error de checksum, o algo así.
Pero pensado friamente, no tiene por qué haberlo, ya que el cheksum lo calcula al acabar el backup. Debería tener una comprobación de "todo OK" para generar el checksum, y si no es así, dar un error CLARO para que sepas que no ha salido bien.
Haz la prueba, elimina lo que puedas (pásate nandroids al ordenador) y vuelve a probar...