Si sigues los tutos normales puedes hacerlo. Si no me acuerdo mal, una vez que eres SU, hay que modificar/renombrar un script del sistema que es el que recarga el recovery.
Para ello hay que hacer el unlock. Siguiendo este tuto puedes hacer el backup completo del movil antes de hacer el unlock, y restaurarlo despues.
Un vez que tienes el unlock puedes flashear el recovery. Si tienes modificado el script, no te recargan el recovery, y sigues con el clockwork.
Saludetes,