He conseguido deshacerlo todo.
-Borrando la rom cm12 desde la opción multirom de TWRP.
-Flasheando otro kernel, yo he utilizado este
https://github.com/SuperPichu/shield...ernel/releases
Supuestamente es para la 2.2 pero funciona en 2.2.1.
He dejado el TWRP de multirom, nunca se sabe.
EDITO: Era el kernel el que no dejaba hacer backup, tiene un bug que deniega el permiso de escritura en la extsdcard.