La activación manual siendo root no siempre me ha funcionado, pero para el que quiera probar...
¡¡IMPORTANTE!! ... Antes de nada mata la aplicación WhatsApp y borra el caché.
Utilizando cualquier explorador de ficheros con acceso ROOT busca el siguiente archivo...
/data/data/com.whatsapp/shared_prefs/com.whatsapp_preferences.xml
Edita el archivo, busca las dos líneas siguientes (puede que no estén juntas) y las pones así...
<boolean name="call" value="true" />
<string name="call_allowed">all</string>
Si no las encuentras las añades justo antes de la marca </map> del final para que se quede así...
<?xml version='1.0' encoding='utf-8' standalone='yes' ?>
<map>
.....
<boolean name="call" value="true" />
<string name="call_allowed">all</string>
</map>
Ya puedes abrir de nuevo WhatsApp y probar.