Lo de las apps ancladas también me sucedió, incluso instalaba aplicaciones y se me borraban del menú... lo que hice para solucionarlo fue que luego de instalar la ROM la restablecí de fábrica y se soluciono
ya no se me borran las apps y de hecho funciona mejor que antes, saludos (Es recomendable para cualquiera que instale la ROM que luego de hacerlo, restablezca el sistema de fábrica en configuraciones)