Pues algo mal tienes en el móvil ya sea una app o hardware.
Yo tengo la JPY + CWM + Root exactamente igual que tu y la batería me dura entre 1 día y medio y dos.
Eso si tengo 3G y Wifi desactivados y solo lo activo cuando voy a usarlos, de todas formas teniendo 3G permanente tampoco había excesiva diferencia. El Bluetooth lo tengo siempre activado menos por la noche. Tengo que probar el modem JPD pq el Wifi JPY se come aprox 1% cada dos minutos (20 minutos con pantalla encendida y usándolo para navegar = 10% de batería menos).