Es un problema de la aplicación "supersu" lo que impide poder actualizar los binarios, para solucionarlo haz lo siguiente.

0. Elimina "supersu" con "kingo root" y después vuelve a rootearlo.
1. Te descargas la app "superusuario" en playstore y la instalas.
2. Abres la aplicación "superusuario" y le concedes permisos de root con "superuser".
3. Te descargas la última actualización de "superuser" disponible en playstore y la instalas.
4. Al ejecutar "superuser" te dirá que debes actualizar los binarios, seleccionas la opción normal.

Si todo ha funcionado correctamente se actualizaran los binarios sin problema.

Nota: De todas formas, si queréis evitar este tipo de problemas os recomiendo usar por defecto la app "superususario" y elimináis "superuser".