No se si puede ser lo que te pase pero.... si tienes una partición EXT predeterminada y tienes guardada ahí el nuevo dialer, puede que al reiniciar el teléfono cargue la predeterminada ya que tarda un tiempo en preparar la tarjeta para poder leerla....
A mucha gente le pasa estas cosas y luego se queja de que les va lenta la ROM o algún programa...