jajajajja cierto....
Del Root Manager no te puedo hablar porque no lo he usado... cuando he querido borrar aplis de sistema o hacer backup lo he hecho siempre con el Titanium Backup... De echo de vez en cuando le sigo dando a actualizar las copias de aplis que se han actualizado, que nunca se sabe cuando me va a dar un pronto y voy a meter una ROM nueva ;) jejejej
Si tienes alguna duda concretamente del Titanium pregunta ;)
Respecto a lo de borrar cosillas.... yo borre todas las aplicaciones de t-mobile que venian con la ROM (Revolver.apk, ES_Musica.apk, ....etc incluso el VoiceMail.apk creo recordar que se llamaba asi y servia para escuchar los menajes, pero como no uso buzon de voz...fuera) con el Titanium y no tuve ningun problema.