Creo que puedes eliminarlos cuando la tienes sincronizada con el ordenador, en el ActiveSync le das a explorar y se te abre una ventana con lo que tienes tanto en el teléfono como en la microSD, pues ahí buscas donde tienes lo que quieres borrar y lo borras. A mi no me da ningún problema así... así hago yo con las fotos y todo eso... Prueba a ver si funciona.
Saludos!