A mi solo me pasa con el teclado swype cuando lo uso dentro del juego clash o clans. Se cierra el teclado bastantes veces o tarda en abrirse y es un coñazo. Son dos aplicaciones pesadas, pero leñe, puestos a cerrar el movil debería cerrar una que no se esté usando, no.
Uso greenify con root, pero sin hibernar ninguna de esas dos aplicaciones. Además durante una semana no me dio ningún problema, ha sido en los últimos días...
Seguiré investigando, y si eso desinstalo greenify o hago un hard reset.