Wenas.
Yo para windows xp me he instalado un programa que añade una extensión al menú del boton derecho del ratón, ago click derecho sobre el archivo que quiero mirar el md5 y le doy a md5, se me abre una ventanita con el md5 de ese archivo.
Programa:
http://www.vonwangelin.com/md5/install.exe
Web del programa:
http://www.vonwangelin.com/md5
Espero que te sirba de ayuda.
Un saludo.