Greenify. Funciona sin root y con root, y obviamente va a funcionar mejor y con más posibilidades para desactivar apps siendo root pero algo haces.
Creo que la única manera de cambiar los permisos de las apps es siendo root, pero no estoy seguro.
Para los permisos puedes probar
esta, pero como te dije anteriormente, no estoy seguro que funcione.
Otro administrador de inicios
este