A esto le llamo yo una "cagada en toda regla del cheff".
En un mod de personalización lo que no se hace es sustituir apk,si no sustituir PNG,XML y lo necesario para cambiar el aspecto.
Pero lo mas importante es dar el soporte correcto a los usuarios y más si a habido brickeos,ya que ellos son los que te harán grande o te hundirán en el infierno.