Solucionado, flasheando con fastboot la nueva imagen :
[REF]Nexus 7 (2013) Stock OTA URLs -
http://forum.xda-developers.com/show...php?p=57416220
Done this to pass from 5.0 rooted to 5.0.1:
* fastboot flash system system.img<br />
* fastboot flash boot boot.img<br />
* fastboot format cache<br />
* fastboot reboot<br />
Después flasheando root igual que en la. 5.0