El updater-script es un texto (txt).
El update_ejemplo.zip posiblemente no funcione con la CyanogenMod porque originalmente no tiene /data/app ni contempla esa posibilidad en el updater-script original, con lo cual te falla en esa parte. Por eso también te falla el ROM Cleaner. Con las ROMS que llevan /data/app de origen, te funcionará sin problemas.
De todas formas, para instalar aplicaciones después de flashear, ésto no tiene mucho sentido, porque como te comentan, lo más sencillo y rápido es usar el Titanium Backup y similares.
Yo lo que hago, y de paso te recomiendo, es descomprimir la rom original y de ahí borro lo que no me interesa, o reemplazo unas cosas por otras, vuelvo a comprimir, luego flasheo y finalmente con el Titanium Backup restauro las aplicaciones que me interesan. Para mí es lo más cómodo y tengo la rom a mi gusto.
Saludos, folgui.
