Pues no me acuerdo bien, pero igual tu problema es por eso... Con el de AmonRA si haces wipe a todo no te hace el de la dalvik, por lo que debes hacer wipe ALL y después wipe dalvik. A lo mejor con el ClockWorkMod no se te wipea de forma automática la ext y por eso te da problemas, porque cuando lo he tenido yo recuerdo que sí entraba en un menú que se llamaba "advanced" o algo así y ahí aparecía la opción de más wipes...
Si no lo encuentras, descárgate el AmonRA y flashea por ADB...
Saludos!