Yo hago el backup desde el recovery y cuando quiero lo restauro tambien desde el recovery.
Nunca me ha fallado y eso que pruebo muchos kernels y restauro al momento si me da problemas el kernel.
Hago nandbackup+ext.
EDITO: He mirado por Google y puede que sea cosa de la batería asegurate de tenerla al 90 o 100% o el móvil enchufado a la luz.
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