Es que como estos cacharros vienen como 16GB, realiza un particionado como "Almacenamiento del teléfono" de 3GB y pico, otro como tarjeta SD de menos de 13GB, y luego ya la tarjeta SD de verdad.
Lo que hace es que instala las aplicaciones en esa partición de memoria interna de 13GB, y lo que si me guarda en la SD son las fotos (al menos eso si lo he conseguido).
El que diseño KitKat, considera que si tenemos 16GB de interna, allí hay sitio más que de sobra para aplicaciones, y la SD la dejamos para nuestros mp3, vídeos, fotos, etc, etc...