Yo he descargado el SDK de Android para Windows 64 bits y una vez bajado:
En la carpeta sdk/platform-tools
Creas un documentos de texto y escribes en él: c:\windows\system32\cmd.exe
Lo guardas y renombras el archivo a: Start SDK.bat
Desde ahí ejecutándolo con el archivo en la misma carpeta que quieras flashear, me ha dejado por ejemplo meter un recovery, para el Kernel, lo mismo, pero el comando variará digo yo a: fastboot flash kernel "kernel.img" (sin comillas y sustituyendo kernel.img por el nombre del archivo).