1.guardalas donde quieras, algún lugar seguro.
2.si se puede, pero yo prefiero usar el backup solo en caso de brick, si no vuelvo a stock desde alguna rom con lg mobile partition o algun zip de una stock.
3 . desde el recovery twrp tienes que hacer backup de la efs manualmente.... Hay un post de como se hace en las chinchetas. El efs NO se restaura después de volver de una rom solo cuando tu móvil pierda ese archivo y te haga falta restaurar el IMEI etc.
4.no lo entiendo pero si te refieres a que ahí que instalar las apps por separado... Depende de la rom.
5.para la rotación en caso de que no funcionase flashea su respectivo baseband.
6. Es una respuesta muy larga... El kernel se encarga del funcionamiento del movil y controlarlo, para que haya funcionamiento entre software y hadware y la baseband lleva los datos de Red etc de la señal móvil.