Bueno no se porque dices no hacer wipe completo. En realidad no supone ningún problema, esto es un tema arbitrario de si quieres perder o no tu configuración, quienes quieren nueva rom, nueva configuración desde 0, ya les sirve hacerlo.
Yo me acabo de poner la ultima, la 49 desde clockwork mode, con una tarjeta sd distinta, y el teléfono venia de estar en openfire, lo e reseteado a fabrica y le instalado el zip y sin ningún problema.