Pues yo creo que la culpa no va a ser de nada de lo que comentas que has hecho…
Desde que hay la actualización, que también trae una actualización de firmware, es cuando se han producido todos los problemas de consumo de batería.
Yo hice la actualización y a raíz de tener problemas con el router wifi, ya solucionados, instalé el nandbackup que tenía anterior a la actualización. Esto me soluciono el problema del router wifi, pero el consumo seguía siendo muy superior. Aunque funcionaba con 4.4.3 el firmware seguía siendo el actual.
Según mi opinión, no es un problema de rom, no es un problema de apps que drenen la batería, no es un problema de uso ni de dalvik o art, para mí es un problema de firmware.
Saludos