Si usas apkmanager tienes que actualizar el framework si quieres modificar el settings..etc...en la carpeta apktool que estará en la raíz de tu ordenador cambia los dos serie has mencionado renombrado el framework a 1.apk y el SemcGenericUxpRes.apk a 2.apk
Si quieres modificar el framework,apkmanager, no va a funcionar...podrás modificar y compilar incluso firmarlo, pero akl instalarlo fallará.Tienes que usar el avances apktool de dbfreak
http://forum.xda-developers.com/show....php?t=2639400