A ver, vayamos aclarando términos.
Las rom que son LIBRES, NO tienen bloatware de operadora. Otra cosa es que se posteen como libres y vengan con cosas de operador, como ha pasado alguna vez, por ejemplo la F libre de españa venía con cosas de vodafone francia, no sé por qué.
No es necesario hacer full wipe, pero si recomendable, sobretodo si pasamos a una rom de otro operador, o de otro país.
Perdéis OTA solo si hacéis root.
No dan problemas, salvo que la rom venga con problemas. Por ejemplo la H está muy testada y apenas da fallo, también dicen que la J es bastante estable.
Es posible que surjan problemas si actualizáis y no hacéis full wipe, por eso se recomienda empezar de cero.
Para hacer full wipe, cuando flasheais el KDZ con le programa de LG te deja hacerlo de las dos maneras full wipe o actualización, pasaros por el hilo de flasheo y en el tutorial os lo indica.
Yo por ejemplo tuve problemas tras un flasheo limpio, personalmente os recomiendo hacer una instalación limpia, encender el teléfono omitiendo todos los pasos (google, wifi y tal) y después, hacer HARDRESET o full wipe.
Si no sabéis hacer hard reset aquí tenéis el tutorial.
http://solverbase.com/w/LG_G3:_Hard_...(Factory_Reset)
Existen hilos exclusivos para tratar estos temas, por favor utilizadlos