Buenas noches mambru86,
Rootear un dispositivo como movil o un tablet o un reloj, no se pierde las actualizaciones OTA ni la garantía salvo si modificas la rom (por ejemplo instalando otro distinto como Cyanogenmod). Tener root significa que elevas todo los privilegios haciendo como si fuese un administrador total dentro del sistema operativo Windows, pero en Android.
Saludos.