Hola, justo en estos momentos el usuario jarojito está teniendo problemas con el recovery y puedes igual sacar algo de info de ese post,
aquí.
El problema que relatas no lo había oído antes, de hecho lo normal es que al flashear un recovery ese reemplaze al actual y listo. Luego entrarías a él cada vez que quieras con la combinación de encendido y casita, y en las ROMs cocinadas 2.2 también desde el menu desplegable que sale cuando la apagas. Espero que alguien te pueda echar un cable un poco más consistente porque yo no sé lo que te puede pasar. Saludos.