Buenas jacobocz:
Tienes varias opciones para poder hacer una copia de seguridad de tu rom.
Puedes utilizar la aplicacion Titanium Backup, aunque a mi no me gusta demasiado, ya que alguna vez me ha dado problemillas.
Puedes utilizar como hago yo, el propio recovery para hacer la copia.
El recovery TWRP permite hacer un backup completo de todo el telefono. Puedes descargarlo desde aqui
http://teamw.in/project/twrp2/115.
Y luego puedes mirarte este tutorial
http://www.htcmania.com/showthread.php?t=593074