Creo que lo que tienes que hacer para evitar eso es cuando quieras pasar archivos a la SD, no lo hagas nunca con Android encendido, sino desde WM (si CrAzY_CbR no me corrige)
Así evitarás que te aparezcan esos archivos y que se te corrompa la SD.
Que CrAzY confirme o desmienta...
