Yo he tenido los dos. Ahora poseo un Note 3, y la verdad es que son muy diferentes.
El Z2 tiene una cámara espectacular, en mi opinión, la mejor cámara que he probado nunca, de veras. Es algo más pequeño (son 5.2 pulgadas, no 5), y los marcos son mayores, pero es resistente al agua y al polvo (aunque el mío nunca se mojó). Aunque no se le pueda cambiar la batería, la autonomía del móvil da para 2 días (al menos a mí).
También lleva el hardware de cancelación de ruido, que es muy útil si te gusta salir a correr y tal...
Yo lo cambié porque se me quedaba pequeño en mis manos (sí, son grandes,

).
En el Note 3 la pantalla es mucho mayor, y, aunque la interfaz de samsung la odio a muerte, a mí se me hace más cómodo. Para trabajar, por ejemplo, me viene mucho mejor el note que el Z2.
Ya te digo que cada cual es bueno en lo suyo, yo opino que uno no es mejor que el otro ni de coña. Tienes que mirar cuál se adapta más a lo que buscas.
Un saludo!