Ten en cuenta que algunos archivos se usan en ambos scripts, pero el contenido de esos archivos varia de uno al otro, por lo tanto, el script que instales en ultimo lugar chafara los archivos del script anterior, no creo que sea muy buena idea usar los dos a la vez, ya que el funcionamiento no sera optimo, de ahí que el autor de Fly-On Mod aconseje no instalar otro script de performance.
Así por encima veo que bastantes archivos se chafarían:
system/xbin/openvpn
system/xbin/zipalign
system/etc/init.d/sqlite_optimize
...y si te fijas veras que de un script a otro varia el tamaño y por lo tanto el contenido.
