¿Le has echado un vistazo a este hilo?
http://www.htcmania.com/showthread.php?t=871213
Si funciona con un bolígrafo normal, o un lápiz o cualquier cosa, porque no iba a funcionar con el SPen? lo que sí que no te funcionara es el menú que sale al acercar el SPen, pero creo que es más un problema de software que de hardware, porque digo esto? pues porque si además de aumentar la sensibilidad activas el Airview al igual que el Note detecta cuando pones un bolígrafo a un centímetro de la pantalla (sin tocarla), con lo que si hubiese un software adecuado mostraría el menú y demás...