Para correr la Ruu desde ubuntu lo mejor es emularlo. Osea, hazte una pasticion en el disco y tiralo con WMware. Si lo dejas instalado es mejor porque asi ya lo tienes para la proxima, eso si, tendras que meterle al systerma lo requerido antes, SDK, java, Drivers HTC etc...ok??
Yo con Wine No me arriesgaria, ok?