A ver, yo no controlo mucho de esto, pero siempre que he instalado una ROM, sea MIUI o stock Android, primero entro en Recovery, a continuación hago los wipes, luego instalo la nuevo ROM, y después reinicio, y ya. Y nunca he tenido problemas. De hecho ahora tengo la 24 de Miui.es y no creo que la cambie de momento porque me va de lujo...a no ser que saquen kitkat y funcione fina.
Un saludo!