Hola @Dani_RR
A mi me paso lo mismo intentando instalar un recovery modificado, que cambió el tamaño de las particiones y no hubo manera de volver a instalarlos con ninguno de los métodos que conozco.
Ni restaurando la copia de los mismos con MobileUncle Tools, ni con MTK Droid Root & Tools e incluso con un programa que sirve solo para modificar los IMEI's.
En mi caso fue por que se modificaron las particiones de la rom, no se por que te ha pasado a ti, y la unica solucion que me sirvió es volver a flashear la stock rom, la 1.0.3 con SP Flash Tools y listo, ya vuelves a tener tus IMEI's y ya vuelves a tener cobertura,acceso a SIM's,etc,etc.
Salu2!